2017 жылғы қараша айында Қазақстан Республикасы Инвестициялар және даму министрлігі Көлік комитетінің (бұдан әрі-филиал) «Қазақстан су жолдары» республикалық мемлекеттік қазыналық кәсіпорнының Теңіз навигациялық орталығы құрылған.
2019 жылдың наурыз айында Қазақстан Республикасы Индустрия және инфрақұрылымдық даму министрлігі Көлік комитетінің «Қазақстан су жолдары» республикалық мемлекеттік қазыналық кәсіпорнының Теңіз навигациялық орталығы филиалы болып қайта аталды.
Қазақстан Республикасы Көлік министрінің міндетін атқарушының 2023 жылғы 15 қыркүйектегі «Кейбір мемлекеттік заңды тұлғаларды қайта атау туралы» № 2 бұйрығына сәйкес бастап филиал Қазақстан Республикасы Көлік министрлігі Теміржол және су көлігі комитетінің «Қазақстан су жолдары» республикалық мемлекеттік қазыналық кәсіпорны "Теңіз навигациялық орталық" филиалы болып қайта аталды.
Филиал қызметінің мақсаты Маңғыстау облысының Түпқараған шығанағындағы кеме қозғалысын басқару жүйесімен навигациялық қауіпсіздікті қамтамасыз ету болып табылады.
Жүйенің міндеттері:
1. ҚҚБҚ іс-әрекет аймағында навигацияның қауіпсіздігін қамтамасыз ету;
2. Жүк тасымалдау тиімділігін және порт өнімділігін арттыру;
3. Теңіздегі өмірді қорғауға және қоршаған ортаны қорғауға үлес қосу.
ҚҚБҚ негізгі функциялары:
1. Радиолокациялық және автоматты түрде тәуелді бақылау, кемелердің қозғалысы және бекіту кезінде олардың орналасуы;
2. Навигациялық, метеорологиялық, операциялық және басқа да ақпаратты кемелерге беру;
3. Кемелердің қозғалысын ұйымдастыру және реттеу.
Қосымша қызметтердің мүмкіндіктері:
1. ҚҚБҚ қамту аймағында кемелерді анықтау тәсілдері;
2. Олармен байланыс орнату, әр кеме туралы қажетті мәліметтерді алу;
3. Метеорологиялық, навигациялық, гидрографиялық және басқа да ақпаратты ҚҚБҚ-нің аумағында көрші жағалаудағы қызметтерден алу, оның функцияларын орындау үшін қажетті деректерді тіркеу;
4. Қатысушыларға құтқару және іздестіру іс-шараларын жүргізу бойынша үйлестіру және көмек көрсету;
5. Қоршаған ортаны қорғау және ластанудың салдарын жою мәселелеріндегі теңіз порты әкімшіліктеріне көмек көрсету;
6. Порт диспетчерімен және теңіз порт әкімшілігімен мен өзара әрекеттесу;
7. ҚҚБҚ іс-әрекет аймағында буксирлеуге, бұрғылауға және басқада арнайы жұмыстарға көмек көрсету;
8. Жағалау ұйымдары мен қызмет арасында кемелермен байланыс орнатуға көмек көрсету;
9. ҚҚБҚ іс-әрекет аймағында өзгермелі кемелердің навигациялық қолдауының қалыпты орындарында болуын бақылау;
10. Кемелердің қозғалысы туралы ақпарат пен статистикалық директерді жинау, өңдеу, құжаттау және сақтау;
11. Кеме қатынасы, шекара және кеден режимдеріне мемлекеттік қадағалауды ақпараттық қолдау.
Түпқараған шығанағындағы ҚҚБҚ республикадағы бірінші және қазіргі уақытта жалғыз. Оның табысты қызметі халықаралық теңiздегi қауiпсiздiк жүйесiнде Қазақстанның рөлiн күшейтуге елеулi үлес қосады.